Fremskridt inden for nanodiske platforme til membranproteinoprensning

• Yin H.
• Flynn AD

Lægemiddelmembranproteininteraktioner.

Annu. Rev. Biomed. Eng. 2016; 18: 51-76

• García-Nafría J.
• Tate CG

Kryo-elektronmikroskopi: bevæger sig ud over røntgenkrystalstrukturer for lægemiddelreceptorer og lægemiddeludvikling.

Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2019; 60: 51-71

• Patching SG

Overfladeplasmonresonansspektroskopi til karakterisering af membranprotein-ligand-interaktioner og dets potentiale for lægemiddelopdagelse.

Biochim. Biophvs. Acta. 2014; 1838: 43-55

• Opella SJ
• Marassi FM

Strukturbestemmelse af membranproteiner ved NMR-spektroskopi.

Chem. Rev. 2004; 104: 3587-3606

• Carpenter EP
• et al.

Overvindelse af udfordringerne ved membranproteinkrystallografi.

Curr. Opin. Struktur. Biol. 2008; 18: 581-586

• Privé GG

Detergenter til stabilisering og krystallisering af membranproteiner.

Metoder. 2007; 41: 388-397

• Bayburt TH
• Sligar SG

Selvsamling af enkelt integrerede membranproteiner til opløselige phospholipid-dobbeltlag i nanoskala.

Prot. Sci. 2009; 12: 2476-2481

• Leitz AJ
• et al.

Funktionel rekonstitution af β2-adrenerge receptorer ved hjælp af selvsamlende nanodiske teknologi.

Bioteknikker. 2006; 40: 601-612

• Denisov IG
• et al.

Styret selvsamling af monodisperse phospholipid tolags nanoskiver med kontrolleret størrelse.

J. Am. Chem. Soc. 2004; 126: 3477-3487

• Shaw AW
• et al.

Fosfolipidfaseovergange i homogene tolagsskiver i nanometerskala.

FEBS Lett. 2004; 556: 260-264

• Arana MR
• et al.

Funktionel og strukturel sammenligning af ABC-eksportøren MsbA undersøgt i vaskemiddel og rekonstitueret i nanodiske.

Biochem. Biophvs. Res. Commun. 2019; 512: 448-452

• Reis RI
• Moraes I.

Undersøgelse af membranproteinsamling i nanodiske ved in situ dynamisk lysspredning: A2a-receptor som et casestudie.

Biologi (Basel). 2020; 9: 400

• Bocquet N.
• et al.

Realtidsovervågning af bindingsbegivenheder på en termostabiliseret human A2A-receptor indlejret i et lipiddobbeltlag ved overfladeplasmonresonans.

BBA Biomembr. 2015; 1848: 1224-1233

• Staus DP
• et al.

Struktur af M2 muscarin receptor-β-arrestin kompleks i en lipid nanodisk.

Nature. 2020; 579: 297-302

• Shen PS
• et al.

Strukturen af ​​den polycystiske nyresygdomskanal PKD2 i lipidnanoskiver.

Celle. 2016; 167: 763-773

• Winterstein LM
• et al.

Rekonstitution og funktionel karakterisering af ionkanaler fra nanodiske i lipid-dobbeltlag.

J. Gen. Physiol. 2018; 150: 637-646

• Autzen HE
• et al.

Struktur af den humane TRPM4 ionkanal i en lipid nanodisk.

Science. 2018; 359: 228-232

• Borch J.
• et al.

Nanoskiver til immobilisering af lipid-dobbeltlag og membranreceptorer: kinetisk analyse af koleratoksinbinding til en glycolipidreceptor.

Anal. Chem. 2008; 80: 6245-6252

• Boldog T.
• et al.

Nanodiske adskiller kemoreceptor-oligomere tilstande og afslører deres signalegenskaber.

PNAS. 2006; 103: 11509-11514

• Frauenfeld J.
• et al.

Et saposin-lipoprotein nanopartikelsystem til membranproteiner.

Nat. Metoder. 2016; 13: 345-351

• Flayhan A.
• et al.

Saposin lipid nanopartikler: et meget alsidigt og modulært værktøj til membranproteinforskning.

Struktur. 2018; 26: 345-355

• Dørr JM
• et al.

Styren-maleinsyre-copolymeren: et alsidigt værktøj i membranforskning.

Eur. Biofys. J. 2016; 45: 3-21

• Ravula T.
• et al.

Polymer nanodiske: fordele og begrænsninger.

Chem. Phys. Lipider. 2019; 219: 45-49

• Fiori MC
• et al.

Polymer nanodiske: diskoide amfifile blokcopolymermembraner som en ny platform for membranproteiner.

Sci. Rep. 2017; 7: 15227

• Smith AAA
• et al.

Lipid nanoskiver via bestilte copolymerer.

Chem. 2020; 6: 2782-2795

• Laursen T.
• et al.

Karakterisering af et dynamisk stofskifte, der producerer forsvarsforbindelsen dhurrin i sorghum.

Science. 2016; 354: 890-893

• Morrison KA
• et al.

Udvikling af metodologi til at undersøge overflade SMALPome af pattedyrceller.

Foran. Mol. Biosci. 2021; 8780033

• Thakur N.
• et al.

Produktion af menneskelig A_2AAR i lipid nanodiske til ¹⁹F-NMR og enkelt-molekyle fluorescensspektroskopi.

STAR Protoc. 2022; 3101535

• Hagn F.
• et al.

Samling af phospholipid nanoskiver af kontrolleret størrelse til strukturelle undersøgelser af membranproteiner ved NMR.

Nat. Protoc. 2018; 13: 79-98

• Lloris-Garcerá P.
• et al.

DirectMX - Et-trins rekonstitution af membranproteiner fra rå cellemembraner til salipro nanopartikler.

Foran. Bioeng. Biotechnol. 2020; 8: 215

• Lyons JA
• et al.

Saposin-lipoprotein stilladser til strukturbestemmelse af membrantransportører.

Metoder Enzymol. 2017; 594: 85-99

• Bold LE
• et al.

Indflydelse af DIBMA-polymerlængde på lipid nanodisk dannelse og membranproteinekstraktion.

Biomakromolekyler. 2021; 22: 763-772

• Logez C.
• et al.

Detergentfri isolering af funktionelle G-proteinkoblede receptorer til nanometriske lipidpartikler.

Biokemi. 2016; 55: 38-48

• Lavington S.
• Watt A.

Detergentfri solubilisering og oprensning af en G-proteinkoblet receptor ved hjælp af en polymethacrylatpolymer.

Biochim. Biofys. Acta Biomembr. 2021; 1863183441

• Dimitrova VS
• et al.

Detergentalternativer: membranproteinrensning ved hjælp af syntetiske nanodiske polymerer.

Metoder Mol. Biol. 2022; 2507: 375-387

• Bayburt TH
• et al.

Selvsamling af discoide phospholipid tolags nanopartikler med membran stilladsproteiner.

Nano Lett. 2002; 2: 853-856

• Inagaki S.
• et al.

Biofysisk karakterisering af membranproteiner i nanodiske.

Metoder. 2013; 59: 287-300

• Hendes C.
• et al.

Ladeegenskaberne af phospholipid nanoskiver.

Biophvs. J. 2016; 111: 989-998

• Julien JA
• et al.

Hurtig forberedelse af nanodiske til biofysiske undersøgelser.

Arch. Biochem. Biofys. 2021; 712109051

• Mak S.
• et al.

Ekspres inkorporering af membranproteiner fra forskellige humane celletyper i phospholipid-dobbeltlags nanoskiver.

Biochem. J. 2017; 474: 1361-1371

• Civjan N.
• et al.

Direkte solubilisering af heterologt udtrykte membranproteiner ved inkorporering i nanoskala lipid-dobbeltlag.

Bioteknikker. 2003; 35: 556-563

• Duan H.
• et al.

Co-inkorporering af heterologt udtrykt Arabidopsis cytochrom P450 og P450 reduktase til opløselige nanoskala lipid-dobbeltlag.

Arch. Biochem. Biofys. 2004; 424: 141-153

• Marty MT
• et al.

Nanodisk-solubiliseret membranproteinbibliotek afspejler membranproteomet.

Anal. Bioanal. Chem. 2013; 405: 4009-4016

• Zhao DY
• et al.

Cryo-EM struktur af den native rhodopsin dimer i nanodiscs.

J. Biol. Chem. 2019; 294: 14215-14230

• Bayburt TH
• et al.

Transducin-aktivering ved nanoskala lipid-dobbeltlag indeholdende et og to rhodopsiner.

J. Biol. Chem. 2007; 282: 14875-14881

• Huang W.
• et al.

Struktur af neurotensinreceptor 1 i kompleks med β-arrestin 1.

Nature. 2020; 579: 303-308

• Lee Y.
• et al.

Molekylær basis for β-arrestin-kobling til formoterol-bundet β1-adrenoceptor.

Nature. 2020; 583: 862-866

• Maharana J.
• et al.

Ny strukturel indsigt i GPCR-β-arrestin interaktion og funktionelle resultater.

Curr. Opin. Struktur. Biol. 2022; 75102406

• Zhang M.
• et al.

Cryo-EM-struktur af et aktiveret GPCR-G-proteinkompleks i lipid-nanodiske.

Nat. Struktur. Mol. Biol. 2021; 28: 258-267

• Nasr ML
• et al.

Kovalent cirkulært nanodiske til undersøgelse af membranproteiner og viral indtræden.

Nat. Metoder. 2017; 14: 49-52

• Johansen NT
• et al.

Cirkulariserede og opløselighedsforøgede MSP'er letter enkel og højtydende produktion af stabile nanodiske til studier af membranproteiner i opløsning.

FEBS J. 2019; 286: 1734-1751

• Sun R.
• et al.

Nanodiske, der inkorporerer naturlig β1-adrenerg receptor som en ny tilgang til påvisning af patologiske autoantistoffer hos patienter med dilateret kardiomyopati.

J. Appl. Lab. Med. 2019; 4: 391-403

• Gardill B.
• et al.

Nanodisc-teknologi letter identifikation af monoklonale antistoffer rettet mod multi-pass membranproteiner.

Sci. Rep. 2020; 10: 1130

• Shamin M.
• et al.

En tetramer samling af saposin A: øget strukturel diversitet i lipidoverførselsproteiner.

Kontakt. 2021; 4: 1-11

• Kishimoto Y.
• et al.

Saposiner: struktur, funktion, fordeling og molekylær genetik.

J. Lipid Res. 1992; 33: 1255-1267

• Popovic K.
• et al.

Struktur af saposin A lipoproteinskiver.

PNAS. 2011; 109: 2908-2912

• Chien CTH
• et al.

Et tilpasningsdygtigt phospholipidmembranmimetisk system til opløsnings-NMR-undersøgelser af membranproteiner.

J. Am. Chem. Soc. 2017; 139: 14829-14832

• Rahman MM
• et al.

Oprensning af en naturlig nikotinreceptor.

Metoder Enzymol. 2021; 653: 189-206

• Zhou F.
• et al.

Footprinting massespektrometri af membranproteiner: ferroportin rekonstitueret i saposin A picodiscs.

Anal. Chem. 2021; 93: 11370-11378

• Du D.
• et al.

Interaktioner af en bakteriel RND-transporter med et transmembrant lille protein i et lipidmiljø.

Struktur. 2020; 28: 625-634

• Zhang K.
• et al.

Fusionsproteinstrategier til kryo-EM-undersøgelse af G-proteinkoblede receptorer.

Nat. Commun. 2022; 13: 4366

• Rahman MM
• et al.

Struktur af den native muskel-type nikotinreceptor og hæmning af slangegift toksiner.

Neuron. 2020; 106: 952-962

• Noviello CM
• et al.

Struktur og gating-mekanisme af α7-nikotinacetylcholinreceptoren.

Celle. 2021; 184: 2121-2134

• Gharpure A.
• et al.

Agonistselektivitet og ionpermeation i den α3β4-ganglioniske nikotinreceptor.

Neuron. 2019; 104: 501-511

• Hawkins OP
• et al.

Membranproteinekstraktion og oprensning ved hjælp af delvist esterificerede SMA-polymerer.

Biochim. Biofys. Acta Biomembr. 2021; 1863183758

• Knowles TJ
• et al.

Membranproteiner solubiliseret intakt i lipidholdige nanopartikler bundet af styrenmaleinsyrecopolymer.

J. Am. Chem. Soc. 2009; 131: 7484-7485

• Bada Juarez JF
• et al.

Detergentfri ekstraktion af en funktionel lav-udtrykkende GPCR fra en human cellelinje.

Biochim. Biofys. Acta Biomembr. 2020; 1862183152

• Morrison KA
• et al.

Membranproteinekstraktion og oprensning ved hjælp af styren-maleinsyre (SMA) copolymer: virkning af variationer i polymerstruktur.

Biochem. J. 2016; 473: 4349-4360

• Dørr JM
• et al.

Vaskemiddelfri isolering, karakterisering og funktionel rekonstitution af en tetramer K⁺ kanal: kraften i native nanodiscs.

Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2014; 111: 18607-18612

• Stroud Z.
• et al.

Oprensning af membranproteiner fri for konventionelle detergenter: SMA, nye polymerer, nye muligheder og ny indsigt.

Metoder. 2018; 147: 106-117

• Qiu W.
• et al.

Struktur og aktivitet af lipid-dobbeltlag i en membran-proteintransporter.

PNAS. 2018; 115: 12985-12990

• Parmar M.
• et al.

Brug af en SMALP platform til at bestemme en sub-nm enkelt partikel kryo-EM membran protein struktur.

Biochim. Biofys. Acta Biomembr. 2018; 1860: 378-383

• Li J.
• et al.

Cryo-EM strukturer af Escherichia coli cytokrom bo₃ afsløre bundne fosfolipider og ubiquinon-8 i et dynamisk substratbindingssted.

Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2021; 118e2106750118

• Sol C.
• et al.

Struktur af det alternative kompleks III i et superkompleks med cytochromoxidase.

Nature. 2018; 557: 123-126

• Hal SCL
• et al.

En syre-kompatibel co-polymer til solubilisering af membraner og proteiner til lipid-dobbeltlag-holdige nanopartikler.

Nanoskala. 2018; 10: 10609-10619

• Ravula T.
• et al.

Bioinspireret, størrelsesjusterbar selvsamling af polymer-lipid tolags nanodiske.

Angew. Chem. Int. Ed. 2017; 56: 11466-11470

• Ravula T.
• et al.

Dannelse af pH-resistente monodispergerede polymer-lipid nanoskiver.

Angew. Chem. 2018; 130: 1356-1359

• Ravula T.
• et al.

Effekt af polymerladning på funktionel rekonstitution af membranproteiner i polymernanodiske.

Chem. Commun. 2018; 54: 9615-9618

• Ravula T.
• Ramamoorthy A.

Måling af resterende dipolære koblinger ved hjælp af magnetisk justerede og vendte nanodiske.

Langmuir. 2022; 38: 244-252

• Ravula T.
• Ramamoorthy A.

Magnetisk justering af polymer-makro-nanoskiver muliggør residual-dipolær-kobling-baserede højopløselige strukturelle undersøgelser ved NMR-spektroskopi.

Angew. Chem. Int. Ed. 2019; 58: 14925-14928

• Oluwole AO
• et al.

Solubilisering af membranproteiner i funktionelle lipid-dobbeltlags nanodiske ved hjælp af en diisobutylen/maleinsyre-copolymer.

Angew. Chem. 2017; 56: 1919-1924

• Yasuhara K.
• et al.

Spontan lipid nanodisk dannelse af amfifile polymethacrylat copolymerer.

J. Am. Chem. Soc. 2017; 139: 18657-18663

• Ravula T.
• et al.

Syntese, karakterisering og nanodisk dannelse af ikke-ioniske polymerer.

Angew. Chem. Int. Ed. 2021; 60: 16885-16888

• Gulamhussein AA
• et al.

En sammenligning af SMA (styrenmaleinsyre) og DIBMA (di-isobutylenmaleinsyre) til membranproteinoprensning.

Biochim. Biofys. Acta Biomembr. 2020; 1862183281

• Voskoboynikova N.
• et al.

Lipiddynamik i diisobutylen-maleinsyre (DIBMA) lipidpartikler i nærvær af sensorisk rhodopsin II.

Int. J. Mol. Sci. 2021; 22: 2548

• Harwood CR
• et al.

Funktionel solubilisering af β2-adrenoceptoren under anvendelse af diisobutylenmaleinsyre.

iScience. 2021; 24103362

• Oluwole AO
• et al.

Dannelse af lipid-dobbeltlags nanoskiver med diisobutylen/maleinsyre (DIBMA) copolymer.

Langmuir. 2017; 33: 14378-14388

• Krishnarjuna B.
• et al.

Forbedring af stabiliteten og homogeniteten af ​​ikke-ioniske polymer nanodiske ved at indstille elektrostatiske interaktioner.

J. Colloid interface Sci. 2023; 634: 887-896

• Krishnarjuna B.
• et al.

Ikke-ioniske inulinbaserede polymernanoskiver muliggør funktionel rekonstituering af et redoxkompleks sammensat af modsat ladet CYP450 og CPR i en lipid-dobbeltlagsmembran.

Anal. Chem. 2022; 94: 11908-11915

• Kehlenbeck DM
• et al.

Sammenligning af lipidbærersystemer for integrale membranproteiner - MsbA som casestudie.

Biol. Chem. 2019; 400: 1509-1518

• Denisov IG
• et al.

Kooperativitet i cytochrom P450 3A4: bindinger i substratbinding, spintilstand, afkobling og produktdannelse.

J. Biol. Chem. 2007; 282: 7066-7076

• Grinkova Yv
• et al.

Engineering udvidede membran stilladsproteiner til selvsamling af opløselige nanoskala lipid-dobbeltlag.

Protein Eng. Des. Sel. 2010; 23: 843-848

• Hagn F.
• et al.

Optimerede phospholipid tolags nanodiscs letter strukturbestemmelse i høj opløsning af membranproteiner.

J. Am. Chem. Soc. 2013; 135: 1919-1925

• Miehling J.
• et al.

En split-intein-baseret metode til effektiv produktion af cirkulære nanodiske til strukturelle undersøgelser af membranproteiner.

ChemBioChem. 2018; 19: 1927-1933

• Yusuf Y.
• et al.

Optimering af produktionen af ​​kovalent cirkulære nanoskiver og deres karakterisering under fysiologiske forhold.

Langmuir. 2018; 34: 3525-3532

• Zhang S.
• et al.

Et-trins konstruktion af cirkulære nanodiske ved hjælp af SpyCatcher-SpyTag.

Nat. Commun. 2021; 12: 5451