Badanie zakresu żywicieli do genetycznego transferu biosyntezy organelli magnetycznych

Opublikowane ponownie przez Plato

Obserwuje: 0

Choi, J., Hwang, J., Kim, JY i Choi, H. Niedawny postęp w dziedzinie mikrorobotów uruchamianych magnetycznie do ukierunkowanego dostarczania środków terapeutycznych. Adv. Zdrowie c. Mater. 10, 2001596 (2021).

Artykuł CAS Google Scholar

Schmidt, CK, Medina-Sánchez, M., Edmondson, RJ & Schmidt, OG Inżynieria mikrorobotów do celowanych terapii nowotworowych z medycznego punktu widzenia. Nat. Commun. 11, 5618 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Aubry, M. i in. Inżynieria E. coli do sterowania magnetycznego i przestrzennej lokalizacji funkcji. Syntezator ACS. Biol. 9, 3030 – 3041 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Cho, IH i Ku, S. Aktualne podejścia techniczne do wczesnego wykrywania patogenów przenoszonych przez żywność: wyzwania i możliwości. Int. J. Mol. Sci. 18, 2078 (2017).

Artykuł Google Scholar

Taukulis, R. i in. Magnetyczne nanocząstki tlenku żelaza jako środki kontrastowe w MRI – kompleksowe badania fizyczne i teoretyczne. Magnetohydrodynamika 51, 721 – 748 (2015).

Artykuł Google Scholar

Huang, J., Zhong, X., Wang, L., Yang, L. i Mao, H. Poprawa kontrastu i metod wykrywania rezonansu magnetycznego za pomocą opracowanych nanocząstek magnetycznych. Teranostyka 2, 86 – 102 (2012).

Artykuł Google Scholar

Nishida, K. i Silver, PA Indukcja magnetyzacji biogennej i kontroli redoks przez składnik celu szlaku sygnalizacyjnego kompleksu rapamycyny 1. PLoS Biol. 10, e1001269 (2012).

Artykuł CAS Google Scholar

Nimpf, S. & Keays, DA Czy magnetogenetyka to nowa optogenetyka? EMBO J. 36, 1643 – 1646 (2017).

Artykuł CAS Google Scholar

Pekarsky, A. i Spadiut, O. Komórki wewnętrznie magnetyczne: przegląd ich naturalnego występowania i wytwarzania syntetycznego. Z przodu. Bioeng. Biotechnol. 8, 573183 (2020).

Artykuł Google Scholar

Del Sol-Fernández, S. i in. Magnetogenetyka: zdalna aktywacja funkcji komórkowych wyzwalana przez przełączniki magnetyczne. Nanoskal 14, 2091 – 2118 (2022).

Artykuł Google Scholar

Vargas, G. i in. Zastosowania bakterii magnetotaktycznych, magnetosomów i kryształów magnetosomów w biotechnologii i nanotechnologii: miniprzegląd. Cząsteczki 23, 2438 (2018).

Artykuł Google Scholar

Uebe, R. i Schüler, D. Biogeneza magnetosomów w bakteriach magnetotaktycznych. Nat. Ks. Microbiol. 14, 621 – 637 (2016).

Artykuł CAS Google Scholar

Mickoleit, F. i Schüler, D. Wytwarzanie wielofunkcyjnych nanocząstek magnetycznych o wzmocnionych aktywnościach katalitycznych poprzez ekspresję genetyczną układów enzymów na magnetosomach bakteryjnych. Przysł. Biosyst. 2, 1700109 (2018).

Artykuł Google Scholar

Mickoleit, F. i Schüler, D. Wytwarzanie biokompozytów nanomagnetycznych metodą inżynierii genetycznej magnetosomów bakteryjnych. Bioinspirowany Biomim. Nanobiomateriały 8, 86 – 98 (2018).

Artykuł Google Scholar

Mickoleit, F., Lanzloth, C. i Schüler, D. Wszechstronny zestaw narzędzi do kontrolowanej i wysoce selektywnej wielofunkcyjności bakteryjnych nanocząstek magnetycznych. Mały 16, 1906922 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Kuzajewska, D., Wszołek, A., Żwierełło, W., Kirczuk, L. i Maruszewska, A. Magnetotaktyczny bakterie i magnetosomy jako inteligentne systemy dostarczania leków: nowa broń na polu walki z nowotworem? Biologia 9, 102 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Boucher, M. i in. Genetycznie dostosowane magnetosomy stosowane jako sonda MRI do obrazowania molekularnego guza mózgu. Biomateriały 121, 167 – 178 (2017).

Artykuł CAS Google Scholar

Kraupner, A. i in. Magnetosomy bakteryjne – potężny wkład natury w badania znaczników MPI. Nanoskal 9, 5788 – 5793 (2017).

Artykuł CAS Google Scholar

Le Fèvre, R. i in. Zwiększona skuteczność przeciwnowotworowa biokompatybilnych magnetosomów w leczeniu glejaka wielopostaciowego za pomocą hipertermii magnetycznej. Teranostyka 7, 4618 – 4631 (2017).

Artykuł Google Scholar

Alphandéry, E. Zastosowania magnetosomów syntetyzowanych przez bakterie magnetotaktyczne w medycynie. Z przodu. Bioeng. Biotechnol. 2, 5 (2014).

Google Scholar

Kolinko, I. i in. Biosynteza nanostruktur magnetycznych w obcym organizmie poprzez transfer klastrów genów magnetosomu bakteryjnego. Nat. Nanotechnologia. 9, 193 – 197 (2014).

Artykuł CAS Google Scholar

Dziuba, MV, Zwiener, T., Uebe, R. i Schüler, D. Jednoetapowy transfer operonów biosyntetycznych zapewnia efekt niemagnetotaktyczny magnetospirillum szczep z terenów podmokłych z biosyntezą magnetosomu. Otaczać. Mikrobiol. 22, 1603 – 1618 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Dziuba, MV i in. Ciche klastry genów kodują biosyntezę organelli magnetycznych w niemagnetotaktycznej bakterii fototroficznej. ISME J. 17, 326 – 339 (2023).

Artykuł CAS Google Scholar

Juodeikis, R. Membrany inżynieryjne w Escherichia coli: magnetosom, rodzina białek LemA i pęcherzyki błony zewnętrznej. Praca doktorska, Uniw. Kenta (2016).

Mag-nanotite: Tworzenie nanocząstek magnetytu w E.coli. iGEM https://2016.igem.org/Team:Kent/Description (2016).

Zestawy narzędzi iGEM: magnetosomy. iGEM https://2011.igem.org/Team:Washington/Magnetosomes/Magnet_Toolkit (2011).

Tworzenie magnetosomu: eksperymenty i wyniki. iGEM https://2014.igem.org/Team:Kyoto/Project/Magnetosome_Formation#experiments (2014).

Sistrom, WR Zapotrzebowanie na sód w procesie wzrostu Sferoidy Rhodopseudomonas. J. Gen. Microbiol. 22, 778 – 785 (1960).

Artykuł CAS Google Scholar

Heyen, U. i Schüler, D. Wzrost i tworzenie magnetosomu przez mikroaerofil magnetospirillum szczepy w fermentorze z kontrolowaną zawartością tlenu. Zał. Mikrobiol. Biotechnologia. 61, 536 – 544 (2003).

Artykuł CAS Google Scholar

Pfennig, N. Rhodopseudomonas acidophila, sp. n., nowy gatunek pączkujących fioletowych bakterii niesiarkowych. J. Bakteriol. 99, 597 – 602 (1969).

Artykuł CAS Google Scholar

Moisescu, C., Ardelean, II i Benning, LG Wpływ i rola warunków środowiskowych na syntezę magnetosomów. Z przodu. Microbiol. 5, 49 (2014).

Artykuł Google Scholar

Grant, CR i in. Odrębne klastry genów napędzają tworzenie organelli ferrosomalnych w bakteriach. Natura 606, 160 – 164 (2022).

Artykuł CAS Google Scholar

Silva, KT i in. Identyfikacja obejmujących cały genom podstawowych i pomocniczych zestawów genów do biosyntezy magnetosomów Magnetospirillum gryphiswaldense. mSystemy 5, e00565-20 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Li, Y., Katzmann, E., Borg, S. i Schüler, D. Peryplazmatyczna reduktaza azotanowa Nap jest wymagana do wzrostu beztlenowego i bierze udział w kontroli redoks biomineralizacji magnetytu w Magnetospirillum gryphiswaldense. J. Bakteriol. 194, 4847 – 4856 (2012).

Artykuł CAS Google Scholar

Li, Y. i in. Cytochrom cd1 reduktaza azotynowa NirS bierze udział w beztlenowej biomineralizacji magnetytu Magnetospirillum gryphiswaldense i do prawidłowego działania wymaga NirN d1 zespół hemu. J. Bakteriol. 195, 4297 – 4309 (2013).

Artykuł CAS Google Scholar

Li, Y., Raschdorf, O., Silva, KT i Schüler, D. Terminalna oksydaza Cbb3 funkcje kontroli redoks biomineralizacji magnetytu w Magnetospirillum gryphiswaldense. J. Bakteriol. 196, 2552 – 2562 (2014).

Artykuł Google Scholar

Wang, Q. i in. Białko regulujące odpowiedź na żelazo IrrB in Magnetospirillum gryphiswaldense MSR-1 pomaga kontrolować równowagę żelaza i tlenu, tolerancję na stres oksydacyjny i tworzenie magnetosomu. Zał. Otaczać. Mikrobiol. 81, 8044 – 8053 (2015).

Artykuł CAS Google Scholar

Li, Y. i in. Czujnik tlenu MgFnr kontroluje biomineralizację magnetytu poprzez regulację denitryfikacji Magnetospirillum gryphiswaldense. Mikrobiol BMC. 14, 153 (2014).

Artykuł Google Scholar

Qi, L. i in. Futro w Magnetospirillum gryphiswaldense wpływa na tworzenie magnetosomów i bezpośrednio reguluje geny biorące udział w metabolizmie żelaza i tlenu. PLoS ONE 7, e29572 (2012).

Artykuł CAS Google Scholar

Kolinko, S., Richter, M., Glöckner, FO, Brachmann, A. i Schüler, D. Genomika pojedynczych komórek ujawnia potencjał biomineralizacji magnetytu i greigitu w niehodowanym wielokomórkowym prokariocie magnetotaktycznym. Otaczać. Mikrobiol. Reprezentant. 6, 524 – 531 (2014).

Artykuł CAS Google Scholar

Popp, F., Armitage, JP i Schüler, D. Polarność magnetotaksji bakteryjnej jest kontrolowana przez aerotaksję poprzez wspólną ścieżkę sensoryczną. Nat. Commun. 14, 5398 (2014).

Artykuł Google Scholar

Rong, C. i in. FeoB2 bierze udział w tworzeniu magnetosomu i ochronie przed stresem oksydacyjnym Magnetospirillum gryphiswaldense szczep MSR-1. J. Bakteriol. 194, 3972 – 3976 (2012).

Artykuł CAS Google Scholar

Rong, C. i in. Gen białka B transportującego żelazo żelaza (feoB1) odgrywa dodatkową rolę w tworzeniu magnetosomu Magnetospirillum gryphiswaldense szczep MSR-1. Res. Mikrobiol. 159, 530 – 536 (2008).

Artykuł CAS Google Scholar

Nelson, LM i Knowles, R. Wpływ tlenu i azotanów na wiązanie azotu i denitryfikację przez Azospirillum brasilense hodowane w hodowli ciągłej. Móc. J. Mikrobiol. 24, 1395 – 1403 (1978).

Artykuł CAS Google Scholar

Bergaust, L., Shapleigh, J., Frostegård, Å. & Bakken, L. Transkrypcja i działalność NO_x reduktazy w Agrobacterium tumefaciens: wpływ dostępności azotanów, azotynów i tlenu. Otaczać. Mikrobiol. 10, 3070 – 3081 (2008).

Artykuł CAS Google Scholar

Kampschreur, MJ i in. Metaboliczne modelowanie denitryfikacji w Agrobacterium tumefaciens: narzędzie do badania związków hamujących i aktywujących szlak denitryfikacji. Z przodu. Microbiol. 3, 370 (2012).

Artykuł Google Scholar

Hershberg, R. i Petrov, DA Selekcja na podstawie odchylenia kodonów. Annu. Ks. Genet. 42, 287 – 299 (2008).

Artykuł CAS Google Scholar

Gomes, ALC i in. Determinanty genomu i sekwencji rządzące ekspresją poziomo nabytego DNA u bakterii. ISME J. 14, 2347 – 2357 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Mickoleit, F. i in. Wysokowydajna produkcja, charakterystyka i funkcjonalizacja rekombinowanych magnetosomów w syntetycznej bakterii Rhodospirillum rubrum „magnetyczny”. Adw. Biol. 5, 2101017 (2021).

Artykuł CAS Google Scholar

Richter, P., Melzer, B. i Müller, FD Oddziałujące baktofiliny wpływają na kształt komórek wielokomórkowych pozbawionych MreB Rhodomicrobium vannielii. PLoS Genet. 19, e1010788 (2023).

Artykuł CAS Google Scholar

Orsi, E., Beekwilder, J., Eggink, G., Kengen, SWM i Weusthuis, RA Rhodobacter sphaeroides do fabryki komórek drobnoustrojów. Biotechnologia. Bioeng. 118, 531 – 541 (2021).

Artykuł CAS Google Scholar

Li, M., Ning, P., Sun, Y., Luo, J. i Yang, J. Charakterystyka i zastosowanie Rhodopseudomonas palustris jako fabryka komórek drobnoustrojów. Z przodu. Bioeng. Biotechnol. 10, 897003 (2022).

Artykuł Google Scholar

Strittmatter, W., Weckesser, J., Salimath, PV & Galanos, C. Nietoksyczny lipopolisacharyd z Rhodopseudomonas sphaeroides ATCC 17023. J. Bakteriol. 155, 153 – 158 (1983).

Artykuł CAS Google Scholar

Lin, TL i in. Podobnie leczy: Działanie farmakologiczne przeciwzapalnych lipopolisacharydów z mikrobiomu jelitowego. Z przodu. Pharmacol. 11, 554 (2020).

Artykuł CAS Google Scholar

Schultheiss, D. i Schüler, D. Rozwój systemu genetycznego Magnetospirillum gryphiswaldense. Łuk. Mikrobiol. 179, 89 – 94 (2003).

Artykuł CAS Google Scholar

Chen, S., Zhou, Y., Chen, Y. i Gu, J. fastp: ultraszybki, uniwersalny preprocesor FASTQ. Bioinformatyka 34, i884–i890 (2018).

Artykuł Google Scholar

Langmead, B. & Salzberg, SL Szybkie wyrównanie odczytu z przerwami za pomocą Bowtie 2. Nat. Metody 9, 357 – 359 (2012).

Artykuł CAS Google Scholar

Kearse, M. i in. Geneious Basic: zintegrowana i rozszerzalna platforma oprogramowania komputerowego do organizacji i analizy danych sekwencyjnych. Bioinforma. Aplikacja 28, 1647 – 1649 (2012).

Artykuł Google Scholar

Contreras-Moreira, B. i Vinuesa, P. GET_HOMOLOGUES, wszechstronny pakiet oprogramowania do skalowalnej i niezawodnej analizy pangenomu drobnoustrojów. Zał. Otaczać. Mikrobiol. 79, 7696 – 7701 (2013).

Artykuł CAS Google Scholar

Waskom, M. seaborn: wizualizacja danych statystycznych. J. Oprogramowanie Open Source 6, 3021 (2021).

Artykuł Google Scholar

Schüler, D., Uhl, R. i Bäuerlein, E. Prosta metoda rozpraszania światła do oznaczania magnetyzmu w Magnetospirillum gryphiswaldense. Mikrobiol FEMS. Łotysz 132, 139 – 145 (1995).

Artykuł Google Scholar