Avanços em plataformas de nanodisco para purificação de proteínas de membrana

Avanços em plataformas de nanodisco para purificação de proteínas de membrana

Nó Fonte: 2016461
    • Yin H.
    • Flynn AD

    Drogando interações de proteínas de membrana.

    Anu. Rev. Biomed. Eng. 2016; 18: 51-76

    • García-Nafría J.
    • Tate CG

    Microscopia crioeletrônica: indo além das estruturas cristalinas de raios-X para receptores de drogas e desenvolvimento de drogas.

    Annu Rev. Pharmacol. Toxicol 2019; 60: 51-71

    • Patching SG

    Espectroscopia de ressonância de plasmon de superfície para caracterização de interações proteína-ligante de membrana e seu potencial para descoberta de drogas.

    Biochim. Biofísica Acta. 2014; 1838: 43-55

    • Opella SJ
    • Marassi FM

    Determinação da estrutura de proteínas de membrana por espectroscopia de RMN.

    Química Rev. 2004; 104: 3587-3606

    • carpinteiro EP
    • et ai.

    Superando os desafios da cristalografia de proteínas de membrana.

    atual Opin. Estrutura. Biol. 2008; 18: 581-586

    • Privé GG

    Detergentes para a estabilização e cristalização de proteínas de membrana.

    Métodos. 2007; 41: 388-397

    • Bayburt TH
    • Sligar SG

    Automontagem de proteínas de membrana integral única em bicamadas fosfolipídicas solúveis em nanoescala.

    Prot. ciência 2009; 12: 2476-2481

    • Leitz AJ
    • et ai.

    Reconstituição funcional de receptores β2-adrenérgicos utilizando tecnologia de nanodisco de automontagem.

    Biotécnicas. 2006; 40: 601-612

    • Denisov IG
    • et ai.

    Automontagem dirigida de nanodiscos de bicamada fosfolipídica monodispersa com tamanho controlado.

    Geléia. Chem. Soc. 2004; 126: 3477-3487

    • Shaw AW
    • et ai.

    Transições de fase fosfolipídicas em discos homogêneos de bicamada em escala nanométrica.

    FEBS Lett. 2004; 556: 260-264

    • Arana MR
    • et ai.

    Comparação funcional e estrutural do exportador ABC MsbA estudado em detergente e reconstituído em nanodiscos.

    Biochem. Biophys. Res. Commun. 2019; 512: 448-452

    • Reis RI
    • Morais I.

    Sondagem da montagem de proteínas de membrana em nanodiscos por dispersão de luz dinâmica in situ: receptor A2a como um estudo de caso.

    Biologia (Basileia). 2020; 9: 400

    • Boquet N.
    • et ai.

    Monitoramento em tempo real de eventos de ligação em um receptor A2A humano termoestabilizado incorporado em uma bicamada lipídica por ressonância de plasmon de superfície.

    BBA Biomembro. 2015; 1848: 1224-1233

    • Status DP
    • et ai.

    Estrutura do complexo receptor muscarínico M2-β-arrestina em um nanodisco lipídico.

    Natureza. 2020; 579: 297-302

    • Shen PS
    • et ai.

    A estrutura do canal de doença renal policística PKD2 em nanodiscos lipídicos.

    Célula 2016; 167: 763-773

    • Winterstein LM
    • et ai.

    Reconstituição e caracterização funcional de canais iônicos de nanodiscos em bicamadas lipídicas.

    J. Gen. 2018; 150: 637-646

    • Autzen HE
    • et ai.

    Estrutura do canal iônico TRPM4 humano em um nanodisco lipídico.

    Ciência. 2018; 359: 228-232

    • Borch J.
    • et ai.

    Nanodiscos para imobilização de bicamadas lipídicas e receptores de membrana: análise cinética da ligação da toxina colérica a um receptor glicolipídico.

    Anal. Química 2008; 80: 6245-6252

    • Boldog T.
    • et ai.

    Os nanodiscos separam os estados oligoméricos dos quimiorreceptores e revelam suas propriedades de sinalização.

    PNAS. 2006; 103: 11509-11514

    • Frauenfeld J.
    • et ai.

    Um sistema de nanopartículas saposina-lipoproteína para proteínas de membrana.

    Nat. Métodos. 2016; 13: 345-351

    • Flayhan A.
    • et ai.

    Nanopartículas lipídicas de saposina: uma ferramenta altamente versátil e modular para pesquisa de proteínas de membrana.

    Estrutura. 2018; 26: 345-355

    • Dörr JM
    • et ai.

    O copolímero estireno-ácido maleico: uma ferramenta versátil na pesquisa de membranas.

    EUR. Biophys. J. 2016; 45: 3-21

    • Ravula T.
    • et ai.

    Nanodiscos de polímeros: vantagens e limitações.

    Chem. Física Lipídios. 2019; 219: 45-49

    • Fiori MC
    • et ai.

    Nanodiscos de polímeros: membranas de copolímeros anfifílicos discoidais como uma nova plataforma para proteínas de membrana.

    Sci. Rep. 2017; 7: 15227

    • Smith AAA
    • et ai.

    Nanodiscos lipídicos via copolímeros ordenados.

    Chem. 2020; 6: 2782-2795

    • Laursen T.
    • et ai.

    Caracterização de um metabolon dinâmico produtor do composto de defesa dhurrin em sorgo.

    Ciência. 2016; 354: 890-893

    • Morrison KA
    • et ai.

    Desenvolvimento de metodologia para investigar o SMALPome de superfície de células de mamíferos.

    Frente. Mol. Biosci. 2021; 8780033

    • Thakur N.
    • et ai.

    Produção de humano A2AAR em nanodiscos lipídicos para 19F-NMR e espectroscopia de fluorescência de molécula única.

    Protocolo STAR. 2022; 3101535

    • Hag F.
    • et ai.

    Montagem de nanodiscos fosfolipídicos de tamanho controlado para estudos estruturais de proteínas de membrana por RMN.

    Nat. Protoc. 2018; 13: 79-98

    • Lloris-Garcerá P.
    • et ai.

    DirectMX – Reconstituição em uma etapa de proteínas de membrana de membranas celulares brutas em nanopartículas salipro.

    Frente. Bioeng. Biotechnol. 2020; 8: 215

    • Lyons JA
    • et ai.

    Andaimes de saposina-lipoproteína para determinação da estrutura de transportadores de membrana.

    Métodos Enzymol. 2017; 594: 85-99

    • Bola LE
    • et ai.

    Influência do comprimento do polímero DIBMA na formação de nanodisco lipídico e extração de proteínas de membrana.

    Biomacromoléculas. 2021; 22: 763-772

    • Logez C.
    • et ai.

    Isolamento sem detergente de receptores funcionais acoplados à proteína G em partículas lipídicas nanométricas.

    Bioquímica. 2016; 55: 38-48

    • Lavington S.
    • Watts A.

    Solubilização e purificação sem detergente de um receptor acoplado à proteína G usando um polímero de polimetacrilato.

    Bioquim. Biophys. Acta Biomembr. 2021; 1863183441

    • Dimitrova VS
    • et ai.

    Alternativas de detergentes: purificação de proteínas de membrana usando polímeros sintéticos de nanodisco.

    Métodos Mol. Biol. 2022; 2507: 375-387

    • Bayburt TH
    • et ai.

    Automontagem de nanopartículas de bicamada fosfolipídica discoidal com proteínas scaffold de membrana.

    Nano Lett. 2002; 2: 853-856

    • Inagaki S.
    • et ai.

    Caracterização biofísica de proteínas de membrana em nanodiscos.

    Métodos. 2013; 59: 287-300

    • Ela C.
    • et ai.

    As propriedades de carga de nanodiscos fosfolipídicos.

    Biofísica J. 2016; 111: 989-998

    • Julien JA
    • et ai.

    Preparação rápida de nanodiscos para estudos biofísicos.

    Arco. Biochem. Biophys. 2021; 712109051

    • Mak S.
    • et ai.

    Incorporação expressa de proteínas de membrana de vários tipos de células humanas em nanodiscos de bicamada fosfolipídica.

    Bioquímica. J. 2017; 474: 1361-1371

    • Civjan N.
    • et ai.

    Solubilização direta de proteínas de membrana expressas de forma heteróloga por incorporação em bicamadas lipídicas em nanoescala.

    Biotécnicas. 2003; 35: 556-563

    • Duan H.
    • et ai.

    Co-incorporação de expresso heterólogo Arabidopsis citocromo P450 e P450 redutase em bicamadas lipídicas solúveis em nanoescala.

    Arco. Biochem. Biophys. 2004; 424: 141-153

    • Marty MT
    • et ai.

    A biblioteca de proteínas de membrana solubilizadas em nanodisco reflete o proteoma de membrana.

    Anal. Bioanal. Química 2013; 405: 4009-4016

    • Zhao DY
    • et ai.

    Estrutura Cryo-EM do dímero de rodopsina nativa em nanodiscos.

    J. Biol. Chem. 2019; 294: 14215-14230

    • Bayburt TH
    • et ai.

    Ativação da transducina por bicamadas lipídicas em nanoescala contendo uma e duas rodopsinas.

    J. Biol. Chem. 2007; 282: 14875-14881

    • Huang W.
    • et ai.

    Estrutura do receptor de neurotensina 1 em complexo com β-arrestina 1.

    Natureza. 2020; 579: 303-308

    • Lee Y.
    • et ai.

    Base molecular do acoplamento da β-arrestina ao adrenoceptor β1 ligado ao formoterol.

    Natureza. 2020; 583: 862-866

    • Maharana J.
    • et ai.

    Insights estruturais emergentes sobre a interação GPCR-β-arrestina e resultados funcionais.

    atual Opin. Estrutura. Biol. 2022; 75102406

    • Zhang M.
    • et ai.

    Estrutura Cryo-EM de um complexo de proteína GPCR-G ativado em nanodiscos lipídicos.

    Nat. Estrutura. Mol. Biol. 2021; 28: 258-267

    • Nasr ML
    • et ai.

    Nanodiscos circularizados covalentemente para estudar proteínas de membrana e entrada viral.

    Nat. Métodos. 2017; 14: 49-52

    • Johansen NT
    • et ai.

    Os MSPs circularizados e com solubilidade aprimorada facilitam a produção simples e de alto rendimento de nanodiscos estáveis ​​para estudos de proteínas de membrana em solução.

    FEBS J. 2019; 286: 1734-1751

    • Sol R.
    • et ai.

    Nanodiscos incorporando o receptor β1 adrenérgico nativo como uma nova abordagem para a detecção de autoanticorpos patológicos em pacientes com cardiomiopatia dilatada.

    J. Appl. Laboratório. Med. 2019; 4: 391-403

    • Gardill B.
    • et ai.

    A tecnologia de nanodisco facilita a identificação de anticorpos monoclonais direcionados a proteínas de membrana de passagem múltipla.

    Sci. Rep. 2020; 10: 1130

    • Shamin M.
    • et ai.

    Um conjunto tetramérico de saposina A: aumentando a diversidade estrutural em proteínas de transferência de lipídeos.

    Contato. 2021; 4: 1-11

    • Kishimoto Y.
    • et ai.

    Saposinas: estrutura, função, distribuição e genética molecular.

    J. Lipid Res. 1992; 33: 1255-1267

    • Popovic K.
    • et ai.

    Estrutura dos discos de lipoproteína de saposina A.

    PNAS. 2011; 109: 2908-2912

    • Chien CTH
    • et ai.

    Um sistema mimético de membrana fosfolipídica adaptável para estudos de solução de NMR de proteínas de membrana.

    Geléia. Chem. Soc. 2017; 139: 14829-14832

    • Rahman MM
    • et ai.

    Purificação de um receptor nicotínico nativo.

    Métodos Enzymol. 2021; 653: 189-206

    • Zhou F.
    • et ai.

    Espectrometria de massa de pegada de proteínas de membrana: ferroportina reconstituída em picodiscos de saposina A.

    Anal. Química 2021; 93: 11370-11378

    • Du D.
    • et ai.

    Interações de um transportador RND bacteriano com uma pequena proteína transmembranar em um ambiente lipídico.

    Estrutura. 2020; 28: 625-634

    • Zhang K.
    • et ai.

    Estratégias de proteínas de fusão para estudo crio-EM de receptores acoplados à proteína G.

    Nat. Comum. 2022; 13: 4366

    • Rahman MM
    • et ai.

    Estrutura do receptor nicotínico do tipo muscular nativo e inibição por toxinas de veneno de cobra.

    Neurônio. 2020; 106: 952-962

    • Noviello CM
    • et ai.

    Estrutura e mecanismo de gating do receptor nicotínico de acetilcolina α7.

    Célula 2021; 184: 2121-2134

    • Gharpura A.
    • et ai.

    Seletividade agonista e permeação iônica no receptor nicotínico ganglionar α3β4.

    Neurônio. 2019; 104: 501-511

    • Hawkins OP
    • et ai.

    Extração e purificação de proteínas de membrana usando polímeros SMA parcialmente esterificados.

    Bioquim. Biophys. Acta Biomembr. 2021; 1863183758

    • Knowles TJ
    • et ai.

    Proteínas de membrana solubilizadas intactas em nanopartículas contendo lipídios delimitadas por copolímero de estireno e ácido maleico.

    Geléia. Chem. Soc. 2009; 131: 7484-7485

    • Bada Juarez JF See More
    • et ai.

    Extração sem detergente de um GPCR funcional de baixa expressão de uma linha celular humana.

    Bioquim. Biophys. Acta Biomembr. 2020; 1862183152

    • Morrison KA
    • et ai.

    Extração e purificação de proteínas de membrana usando copolímero estireno-ácido maleico (SMA): efeito de variações na estrutura do polímero.

    Bioquímica. J. 2016; 473: 4349-4360

    • Dörr JM
    • et ai.

    Isolamento sem detergente, caracterização e reconstituição funcional de um tetramérico K+ canal: o poder dos nanodiscos nativos.

    Proc. Natl. Acad. Sci. EUA 2014; 111: 18607-18612

    • Stroud Z.
    • et ai.

    Purificação de proteínas de membrana livres de detergentes convencionais: SMA, novos polímeros, novas oportunidades e novos insights.

    Métodos. 2018; 147: 106-117

    • Qiu W.
    • et ai.

    Estrutura e atividade da bicamada lipídica dentro de um transportador de proteína de membrana.

    PNAS. 2018; 115: 12985-12990

    • Paramar M.
    • et ai.

    Usando uma plataforma SMALP para determinar uma estrutura de proteína de membrana crio-EM de partícula única sub-nm.

    Bioquim. Biophys. Acta Biomembr. 2018; 1860: 378-383

    • Li J.
    • et ai.

    Estruturas Cryo-EM de Escherichia coli citocromo bo3 revelam fosfolipídios ligados e ubiquinona-8 em um sítio dinâmico de ligação ao substrato.

    Proc. Natl. Acad. Sci. EUA 2021; 118e2106750118

    • Sol C.
    • et ai.

    Estrutura do complexo alternativo III em um supercomplexo com citocromo oxidase.

    Natureza. 2018; 557: 123-126

    • Salão SCL
    • et ai.

    Um copolímero compatível com ácido para a solubilização de membranas e proteínas em nanopartículas contendo bicamada lipídica.

    Nanoescala. 2018; 10: 10609-10619

    • Ravula T.
    • et ai.

    Auto-montagem bioinspirada e ajustável de tamanho de nanodiscos de bicamada de polímero-lipídio.

    Angew. Química Int. Ed. 2017; 56: 11466-11470

    • Ravula T.
    • et ai.

    Formação de nanodiscos de polímero-lipídio monodispersos resistentes a pH.

    Angew. Química 2018; 130: 1356-1359

    • Ravula T.
    • et ai.

    Efeito da carga do polímero na reconstituição funcional de proteínas de membrana em nanodiscos poliméricos.

    Chem. Comum. 2018; 54: 9615-9618

    • Ravula T.
    • Ramamoorthy A.

    Medição de acoplamentos dipolares residuais usando nanodiscos alinhados e invertidos magneticamente.

    Langmuir. 2022; 38: 244-252

    • Ravula T.
    • Ramamoorthy A.

    O alinhamento magnético de macro-nanodiscos de polímero permite estudos estruturais de alta resolução baseados em acoplamento dipolar residual por espectroscopia de NMR.

    Angew. Química Int. Ed. 2019; 58: 14925-14928

    • Oluwole AO
    • et ai.

    Solubilização de proteínas de membrana em nanodiscos funcionais de bicamada lipídica usando um copolímero de diisobutileno/ácido maleico.

    Angew. Química 2017; 56: 1919-1924

    • Yasuhara K.
    • et ai.

    Formação espontânea de nanodisco lipídico por copolímeros anfifílicos de polimetacrilato.

    Geléia. Chem. Soc. 2017; 139: 18657-18663

    • Ravula T.
    • et ai.

    Síntese, caracterização e formação de nanodisco de polímeros não iônicos.

    Angew. Química Int. Ed. 2021; 60: 16885-16888

    • Gulamhussein AA
    • et ai.

    Uma comparação de SMA (ácido estireno maleico) e DIBMA (ácido diisobutileno maleico) para purificação de proteínas de membrana.

    Bioquim. Biophys. Acta Biomembr. 2020; 1862183281

    • Voskoboynikova N.
    • et ai.

    Dinâmica lipídica em partículas lipídicas de ácido diisobutileno-maleico (DIBMA) na presença de rodopsina II sensorial.

    Int. J. Mol. Sci. 2021; 22: 2548

    • Harwood CR
    • et ai.

    Solubilização funcional do β2-adrenoceptor usando ácido diisobutileno maleico.

    iCiência. 2021; 24103362

    • Oluwole AO
    • et ai.

    Formação de nanodiscos de bicamada lipídica por copolímero diisobutileno/ácido maleico (DIBMA).

    Langmuir. 2017; 33: 14378-14388

    • Krishnarjuna B.
    • et ai.

    Melhorando a estabilidade e a homogeneidade de nanodiscos de polímero não iônico ajustando as interações eletrostáticas.

    J. Interface colóide Sci. 2023; 634: 887-896

    • Krishnarjuna B.
    • et ai.

    Os nanodiscos de polímero não iônico à base de inulina permitem a reconstituição funcional de um complexo redox composto de CYP450 e CPR de carga oposta em uma membrana de camada dupla de lipídios.

    Anal. Química 2022; 94: 11908-11915

    • Kehlenbeck DM
    • et ai.

    Comparação de sistemas de transporte lipídico para proteínas integrais de membrana – MsbA como estudo de caso.

    Biol. Química 2019; 400: 1509-1518

    • Denisov IG
    • et ai.

    Cooperatividade no citocromo P450 3A4: ligações na ligação do substrato, estado de spin, desacoplamento e formação do produto.

    J. Biol. Chem. 2007; 282: 7066-7076

    • Grinkova Yv
    • et ai.

    Engenharia de proteínas de andaime de membrana estendida para automontagem de bicamadas lipídicas solúveis em nanoescala.

    Proteína Eng. Des. Sel. 2010; 23: 843-848

    • Hag F.
    • et ai.

    Nanodiscos de bicamada de fosfolipídeos otimizados facilitam a determinação da estrutura de alta resolução de proteínas de membrana.

    Geléia. Chem. Soc. 2013; 135: 1919-1925

    • Miehling J.
    • et ai.

    Um método baseado em split-intein para a produção eficiente de nanodiscos circularizados para estudos estruturais de proteínas de membrana.

    QuímicaBioChem. 2018; 19: 1927-1933

    • Yusuf Y.
    • et ai.

    Otimização da produção de nanodiscos covalentemente circularizados e sua caracterização em condições fisiológicas.

    Langmuir. 2018; 34: 3525-3532

    • Zhang S.
    • et ai.

    Construção em uma etapa de nanodiscos circularizados usando SpyCatcher-SpyTag.

    Nat. Comum. 2021; 12: 5451

  • Carimbo de hora:

    Mais de Tendências de biotecnologia